MUSES9-HS高光譜相機(jī)應(yīng)用方向
對(duì)植物病害和植物脅迫的可靠檢測(cè)和識(shí)別是目前農(nóng)業(yè)領(lǐng)域的一大挑戰(zhàn)?,F(xiàn)有的標(biāo)準(zhǔn)檢測(cè)方法通常依賴(lài)于農(nóng)作物學(xué)家手動(dòng)檢查作物上可見(jiàn)的癥狀,還要受限于作物的類(lèi)型和作物面積的大小(對(duì)于許多商業(yè)作物來(lái)說(shuō),面積往往很大),這種監(jiān)測(cè)植物健康的方法既費(fèi)時(shí)又費(fèi)力。人工檢測(cè)還依賴(lài)于病害或壓力表現(xiàn)出明顯的癥狀,而這些癥狀經(jīng)常在病害的中后期才表現(xiàn)出來(lái),再通過(guò)人工檢測(cè)或診斷性測(cè)試來(lái)確定病原體。疾病通常從葉片上的一個(gè)小區(qū)域開(kāi)始(例如,由真菌病原體Mycosphaerellagraminicola引起的小麥Septoria tritici blotch(STB);由Venturiainaequalis引起的蘋(píng)果瘡痂),如果作物很大,目視檢查可能很難發(fā)現(xiàn),而能夠在這個(gè)早期階段識(shí)別疾病將會(huì)提供一個(gè)早期干預(yù)的機(jī)會(huì),在整個(gè)作物被感染或損害之前,控制、預(yù)防感染的擴(kuò)散,或改變作物管理方法。識(shí)別受疾病影響的作物區(qū)域還有助于針對(duì)性地應(yīng)用化學(xué)品。這種精確的方法將可以減少農(nóng)藥和除草劑用量,從而對(duì)環(huán)境、生態(tài)系統(tǒng)服務(wù)、種植者的成本和最終消費(fèi)者產(chǎn)生有利影響。因此,農(nóng)業(yè)和園藝部門(mén)對(duì)用更自動(dòng)化的、有針對(duì)性的和精確的方法來(lái)取代這種人工觀察的過(guò)程有著濃厚的興趣。Mahlein發(fā)表了關(guān)于通過(guò)成像傳感器檢測(cè)植物病害的文獻(xiàn),其中包括RGB、多光譜、高光譜、熱能、葉綠素?zé)晒夂腿S傳感器。最終觀點(diǎn)是,RGB和高光譜成像對(duì)于識(shí)別特定疾病的效果來(lái)說(shuō)是比較好的。
為了改善作物管理和植物健康,一些研究集中在如何在開(kāi)始階段識(shí)別到病害,要在出現(xiàn)明顯跡象之前。圖像分析技術(shù)在這方面顯示出很大的潛力,它們代表了檢測(cè)植物中生物和非生物壓力的非侵入性和潛在的自主方法。Singh等人在最近的一篇論文中說(shuō)明了這一點(diǎn),該論文研究了用于脅迫表型的機(jī)器學(xué)習(xí),探討了使用不同傳感器進(jìn)行脅迫識(shí)別、分類(lèi)、量化和預(yù)測(cè)的高通量表型。
作為一個(gè)研究領(lǐng)域,圖像分析代表了大量的計(jì)算技術(shù),能夠從數(shù)字圖像中提取信息。從實(shí)用的角度來(lái)看,這意味著對(duì)精心捕捉的圖像進(jìn)行自動(dòng)處理,從圖像中產(chǎn)生所需測(cè)量的數(shù)據(jù)集。圖像本身可以來(lái)自各種來(lái)源,從彩色數(shù)碼相機(jī)或智能手機(jī),到更專(zhuān)業(yè)的相機(jī),旨在捕捉圖像中的各種不同信息。這里的一個(gè)技術(shù)進(jìn)步是高光譜圖像,相機(jī)捕捉到的不僅僅是傳統(tǒng)數(shù)字圖像中常見(jiàn)的三個(gè)彩色光帶。本論文將特別關(guān)注隨后的分析方法,即高光譜圖像分析。由于技術(shù)成本的下降,這種方法最近在經(jīng)濟(jì)上已經(jīng)可以被廣大用戶(hù)所接受。正在開(kāi)發(fā)的分析方法使高光譜成像技術(shù)能夠被用于更廣泛的應(yīng)用。高光譜成像在很大的光譜范圍內(nèi)使用高保真顏色反射信息(超出人類(lèi)視覺(jué)范圍),因此有可能識(shí)別植物生長(zhǎng)和發(fā)展中的微小變化。
在這篇評(píng)論中,我們概述了高光譜成像技術(shù),以及如何在實(shí)驗(yàn)室和田間應(yīng)用中利用它來(lái)分類(lèi)和識(shí)別植物葉子疾病和壓力的早期階段。從背景理論和高光譜成像技術(shù)的概述開(kāi)始,我們考慮了該方法在植物和作物科學(xué)中的一些應(yīng)用范圍。最后,我們討論了這些方法的一些實(shí)際問(wèn)題;這是一個(gè)重要的方面,因?yàn)檫@種相機(jī)通常還不能作為作物監(jiān)測(cè)的交鑰匙解決方案,所以在這些技術(shù)的部署可以在商業(yè)環(huán)境中實(shí)施之前,必須注意收集令人滿(mǎn)意的數(shù)據(jù),并提供有意義的分析和解釋。
1. 彩色數(shù)字成像
為了理解高光譜技術(shù)本身,首先考慮一下一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)的、非高光譜的彩色數(shù)字圖像包括哪些內(nèi)容,這將是很有幫助的。光的波長(zhǎng)對(duì)應(yīng)于顏色,藍(lán)光的中心波長(zhǎng)約為475納米,綠光為520納米,紅光為650納米。一幅彩色圖像代表了三個(gè)寬波段的組成,紅、綠、藍(lán)。我們的眼睛包含三種類(lèi)型的錐體,對(duì)光譜中的藍(lán)色、綠色和紅色部分敏感,每一種錐體都有一個(gè)顏色范圍,它們受到的刺激或強(qiáng)或弱,取決于發(fā)射光的波長(zhǎng)。結(jié)合來(lái)自三種不同錐體的信息,我們?cè)诖竽X中重建了一個(gè)彩色圖像。數(shù)字圖像試圖模擬錐體的敏感性,一個(gè)像素存儲(chǔ)了光譜中藍(lán)色、綠色或紅色部分的綜合強(qiáng)度,這取決于放置在該像素前端的過(guò)濾器類(lèi)型。高光譜系統(tǒng)中捕獲的光線(xiàn)范圍也會(huì)有所不同。人眼可見(jiàn)的顏色是電磁波譜上的一個(gè)小范圍,從400到700納米(圖1)。通常用于植物高光譜成像的光譜部分從紫外線(xiàn)(UV)(始于約250納米)到短波紅外(SWIR,約2500納米)。照相機(jī)通常捕捉某個(gè)子范圍,如可見(jiàn)光和近紅外范圍(VIS-NIR,400-1300納米)或短波紅外(1300-2500納米)或紫外線(xiàn)(250-400納米),這些范圍在一些傳感器中被結(jié)合起來(lái)以增加光譜的覆蓋范圍。
那么,彩色圖像就是一個(gè)三波段多光譜圖像的例子,其中每個(gè)波段記錄了三種顏色中的一種,即紅、綠和藍(lán)。在真正的多光譜圖像中,通常會(huì)有更多的波段,也許還會(huì)對(duì)光譜中的紅外區(qū)域的光進(jìn)行采樣,即波長(zhǎng)超過(guò)700納米的光。另一方面,高光譜圖像通常包含光譜范圍內(nèi)數(shù)百個(gè)連續(xù)的窄波段。這種方法產(chǎn)生了密集的、信息豐富的彩色數(shù)據(jù)集,具有足夠的空間分辨率,每片葉子有數(shù)百個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)(像素)。
對(duì)于植物和植被,非常有用的分析波長(zhǎng)范圍是可見(jiàn)光范圍和近紅外范圍。這個(gè)波長(zhǎng)范圍可以捕捉到葉子色素(400-700納米)和間葉細(xì)胞結(jié)構(gòu)(700-1300納米)的變化,但是要看到植物的含水量的變化,需要擴(kuò)展范圍(1300-2500納米)。例如,嚴(yán)重脫水會(huì)影響葉子的中葉結(jié)構(gòu),這與近紅外反射率的變化有關(guān),然而,輕微的干旱壓力通常不會(huì)有足夠的影響,無(wú)法被檢測(cè)到。
2. 高光譜成像技術(shù)
高光譜成像光譜儀背后有各種硬件方法,這意味著有不同的方式來(lái)捕獲圖像。成像的設(shè)備包括推掃器、濾波輪、液晶可調(diào)諧過(guò)濾器等等。在一個(gè)使用推掃的案例中,入射光線(xiàn)通過(guò)一個(gè)凸面光柵(或棱鏡),將光線(xiàn)分離成狹窄的波長(zhǎng)。這種分離后面會(huì)被記錄在一個(gè)光敏芯片上(類(lèi)似于標(biāo)準(zhǔn)的數(shù)碼相機(jī))。一個(gè)推掃器,有三個(gè)組成部分;照相機(jī)、光譜儀和鏡頭。這個(gè)系統(tǒng)同時(shí)捕捉圖像的單一空間線(xiàn),以及整個(gè)彩色光譜范圍。然后相機(jī)或物體被移動(dòng),下一條線(xiàn)被捕獲(掃帚被"推"向前方,因此而得名),有效地使相機(jī)成為線(xiàn)掃描器,最終的圖像是在全部掃描完成后建立的。替代推掃的另一種方法是快照方法,即一次性采集整個(gè)圖像。迄今為止,推掃技術(shù)得到了很多的使用,但最近快照技術(shù)的進(jìn)步正在增加與表型和分析有關(guān)的接受度和可能性。
在本綜述的其余部分,我們考慮了高光譜成像技術(shù)和分析的應(yīng)用,并將綜述分為以下四個(gè)部分:(1)現(xiàn)有的植被和病害指數(shù);(2)健康和有病植物的檢測(cè)和分類(lèi)與病害分類(lèi)的應(yīng)用;(3)量化病害的嚴(yán)重程度;以及(4)早期階段檢測(cè)壓力癥狀。
在這些章節(jié)中,我們將考慮基于實(shí)驗(yàn)室的成像方法,以及基于現(xiàn)場(chǎng)的遙感。除了明顯的生物差異外,值得考慮這些環(huán)境對(duì)高光譜圖像數(shù)據(jù)本身的影響?;趯?shí)驗(yàn)室的成像方法是在一個(gè)受控的環(huán)境中進(jìn)行的,其中包括人工光源。室外遙感數(shù)據(jù)通常取決于環(huán)境光照,盡管有一些系統(tǒng)使用受控照明進(jìn)行室外高光譜成像的例子。使用自然光照,即太陽(yáng),意味著認(rèn)識(shí)到存在著大氣效應(yīng),如光的吸收和散射。其他可能導(dǎo)致光譜特征變化的環(huán)境因素有:云影和物體表面之間的相互作用、一天中的時(shí)間、鏡面反射和其他物體的存在,它們可以將二次照明反射到感興趣的區(qū)域。由于這些影響中的許多都與時(shí)間有關(guān),成功使用校準(zhǔn)參考意味著每當(dāng)環(huán)境照明發(fā)生變化時(shí)都要更新參考,這在自然照明情況下可能非常短的時(shí)間。在受控的照明下,仍然存在問(wèn)題:存在著光強(qiáng)度的問(wèn)題:反平方定律指出,照度會(huì)根據(jù)與光源的距離成反比下降。這意味著會(huì)出現(xiàn)不均勻的照明,選擇的光源類(lèi)型需要仔細(xì)考慮,它不應(yīng)該有橫跨光譜或圖像平面的高強(qiáng)度峰值。
實(shí)驗(yàn)室和現(xiàn)場(chǎng)成像之間的另一個(gè)潛在差異是分辨率。對(duì)于航空遙感數(shù)據(jù),空間分辨率通常在每像素米的范圍內(nèi),這意味著像素通常包含一種以上材料的特征。分析這種數(shù)據(jù)的第一步是考慮這種多金屬問(wèn)題,即必須考慮像素包含混合材料(稱(chēng)為"混合像素"),并且必須應(yīng)用光譜解混過(guò)程。換句話(huà)說(shuō),一個(gè)像素可能包含植物和土壤,必須使用算法來(lái)確定適當(dāng)?shù)幕旌稀T趯?shí)驗(yàn)室中,圖像通??梢栽谥参锏膸桌迕追秶鷥?nèi)拍攝,甚至可能有許多像素代表一片葉子或疾病區(qū)域。在這些情況下,一般沒(méi)有必要進(jìn)行解混。
對(duì)這些基于位置的挑戰(zhàn)的進(jìn)一步考慮將在本評(píng)論的后面充分探討,但在我們繼續(xù)之前,讓我們考慮一下為什么我們希望首先捕獲這種高光譜信息。
3. 應(yīng)用于健康和患病植物的檢測(cè)和分類(lèi)
在本節(jié)中,我們將討論專(zhuān)門(mén)用于檢測(cè)植物中生物壓力的各種技術(shù)。分類(lèi)技術(shù),也就是把數(shù)據(jù)分成健康和病害兩類(lèi)的技術(shù),可以分為兩種類(lèi)型:一種是專(zhuān)注于光譜中一些關(guān)鍵波長(zhǎng)的技術(shù),另一種是使用整個(gè)光譜反應(yīng)的技術(shù)。更進(jìn)一步說(shuō),疾病分類(lèi)的討論涉及到多種疾病的識(shí)別和特定疾病的檢測(cè)。
3.1現(xiàn)有的植被和疾病指數(shù)
在高光譜成像設(shè)備出現(xiàn)之前,希望根據(jù)顏色信息對(duì)效果進(jìn)行量化的研究人員已經(jīng)使用多光譜成像或高光譜、點(diǎn)源設(shè)備(如不產(chǎn)生空間圖像的光譜儀)來(lái)獲取顏色數(shù)據(jù)。高光譜設(shè)備一般不提供點(diǎn)對(duì)點(diǎn)的測(cè)量。相反,用戶(hù)有很大的責(zé)任來(lái)開(kāi)發(fā)捕獲過(guò)程。一旦獲得,必須對(duì)產(chǎn)生的大量數(shù)字?jǐn)?shù)據(jù)集進(jìn)行分析,以提供有用的信息。進(jìn)入這種大型數(shù)據(jù)集的一個(gè)明智而簡(jiǎn)單的方法是只考慮波長(zhǎng)范圍內(nèi)的少數(shù)位置,觀察在光譜中預(yù)定的關(guān)鍵點(diǎn)的不同條件的變化。使用這種方法,我們還可以通過(guò)考慮數(shù)據(jù)值的比率來(lái)抵消相對(duì)光變化的影響。這涉及到兩個(gè)或多個(gè)波長(zhǎng)的組合,通常被稱(chēng)為"指數(shù)"。
為了解釋這些數(shù)據(jù),通過(guò)預(yù)先考慮的生物推理(例如知道特定的波長(zhǎng)與特定的細(xì)胞結(jié)構(gòu)的特性有關(guān)),或者由于采集設(shè)備所能提供的特定波長(zhǎng)的限制(例如從衛(wèi)星多光譜遙感數(shù)據(jù)中得出的指數(shù)可能只有有限的波長(zhǎng)可以使用),已經(jīng)開(kāi)發(fā)了一些此類(lèi)指數(shù)。當(dāng)應(yīng)用于植物材料時(shí),這些指數(shù)被稱(chēng)為"植被指數(shù)"。存在許多不同的植被指數(shù),每一種指數(shù)都使用不同的波長(zhǎng)測(cè)量來(lái)描述植被的生理屬性,考察植物的一般屬性或其生長(zhǎng)的具體參數(shù)。
非常流行和廣泛的指標(biāo)之一是歸一化差異植被指數(shù)(NDVI),它被用來(lái)測(cè)量作物的一般健康狀況。它是通過(guò)近紅外光和可見(jiàn)光的簡(jiǎn)單比率來(lái)計(jì)算的(見(jiàn)表1)。NDVI已被用于許多不同的目的,例如,檢測(cè)由Sunnpest谷物害蟲(chóng)EurygasterintegricepsPut.(Hemiptera:Scutelleridae)在小麥中造成的壓力。大多數(shù)指數(shù)是非常具體的,只對(duì)它們所設(shè)計(jì)的數(shù)據(jù)集有良好的效果。有一些以疾病為中心的研究專(zhuān)注于創(chuàng)建疾病指數(shù)來(lái)檢測(cè)和量化特定的疾病,例如,一項(xiàng)研究使用葉銹病嚴(yán)重程度指數(shù)(LRDSI)檢測(cè)小麥的葉銹病(Pucciniatriticina),準(zhǔn)確率為87-91%,然而,據(jù)我們所知,它還沒(méi)有被廣泛測(cè)試。
另一種常用的方法是檢測(cè)紅色/近紅外邊界處反射率突然增加的變化。這個(gè)"紅邊"位置是電磁波譜中的一個(gè)狹窄部分(690-740納米),可見(jiàn)光譜結(jié)束,近紅外開(kāi)始(圖2)。這一段在規(guī)格反應(yīng)(導(dǎo)數(shù))上有很大的變化,對(duì)于綠色植物材料來(lái)說(shuō),由于葉綠素強(qiáng)烈吸收了700納米左右的波長(zhǎng),因此材料在這個(gè)范圍內(nèi)的反射率很低,但它對(duì)紅外線(xiàn)(從720納米左右)有強(qiáng)烈的反射。Cho描述了一些提取或檢測(cè)紅邊的不同算法。一個(gè)基于紅邊位置的疾病指數(shù)被用來(lái)檢測(cè)小麥的白粉?。˙lumeriagraminisf.sp.Tritici),然而它沒(méi)有部分最小二乘回歸(PLSR)那么準(zhǔn)確,后者是一種使用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法的技術(shù)。我們將在本評(píng)論中進(jìn)一步考慮這些統(tǒng)計(jì)學(xué)方法中的一些。
3.2使用選定波長(zhǎng)的子集進(jìn)行分類(lèi)
在這一節(jié)中,我們考慮的是依靠全光譜中特定波長(zhǎng)的子采樣的分類(lèi)方法。與真正的多光譜數(shù)據(jù)不同的是,特定的波長(zhǎng)可以手動(dòng)或自動(dòng)從采集范圍的任何地方選擇,而多光譜數(shù)據(jù)則受技術(shù)限制。
來(lái)自 "背景 "部分的分析通常使用指數(shù)來(lái)計(jì)算代表值,使用光譜中不同位置的離散波長(zhǎng)。其中一項(xiàng)涉及小麥田間實(shí)驗(yàn)的研究使用了歸一化差異植被指數(shù)(NDVI)響應(yīng),從數(shù)據(jù)集中消除了除葉子以外的一切數(shù)據(jù)集,然后用一種叫做"方差分析"的統(tǒng)計(jì)方法方差分析(測(cè)量統(tǒng)計(jì)協(xié)方差),以識(shí)別選定的波段,然后用二次方鑒別分析(QDA)來(lái)對(duì)光譜進(jìn)行分類(lèi)。在健康和病變?nèi)~片(黃銹病)之間進(jìn)行分類(lèi)。這代表了超規(guī)格分析的典型工作流程:隔離(或分割)圖像中感興趣的部分,然后使用數(shù)學(xué)技術(shù)來(lái)識(shí)別光譜中可能具有預(yù)測(cè)能力的區(qū)域,最后使用這些空間和光譜區(qū)域來(lái)學(xué)習(xí)分類(lèi)方法。使用QDA,4個(gè)波段的總體準(zhǔn)確性達(dá)到92%。
Moshou描述了一個(gè)多層感知器(MLP)的例子,他的目的是使用范圍為460-900納米、光譜分辨率為20納米的光譜儀來(lái)檢測(cè)田間生長(zhǎng)的小麥的黃銹病。該分光儀在現(xiàn)場(chǎng)使用一個(gè)手持系統(tǒng)拍攝了圖像。然后選擇了四個(gè)重要的波長(zhǎng)。前兩個(gè)波長(zhǎng)是使用"變量選擇"選擇的,這涉及到使用逐步判別分析和使用F檢驗(yàn)來(lái)比較波長(zhǎng)。第二對(duì)波長(zhǎng)使用NDVI波長(zhǎng)。Moshou使用的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)是一個(gè)簡(jiǎn)單的架構(gòu),有四個(gè)輸入,一個(gè)由十個(gè)神經(jīng)元組成的隱藏層和兩個(gè)輸出(健康和病態(tài))。架構(gòu)是由輸入的數(shù)量、選定的隱藏神經(jīng)元的數(shù)量和所需的輸出數(shù)量決定的。試驗(yàn)和錯(cuò)誤可以用來(lái)確定一個(gè)合適的結(jié)構(gòu)。Moshou嘗試了不同數(shù)量的神經(jīng)元并選擇了非常有效的。使用這種方法達(dá)到的分類(lèi)精度對(duì)健康植物來(lái)說(shuō)是98.9%,對(duì)病變植物來(lái)說(shuō)是99.4%。
MLP方法使用一個(gè)簡(jiǎn)單的架構(gòu),由輸入、隱藏層和輸出組成。在機(jī)器學(xué)習(xí)中,一種新的、更復(fù)雜的方法,即深度學(xué)習(xí),正在變得流行。深度學(xué)習(xí)指的是人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),其結(jié)構(gòu)包含很多層,在每一層中,神經(jīng)元能夠隱含地代表數(shù)據(jù)的特征,通過(guò)這樣做,可以在后面的層中獲得更復(fù)雜的信息,圖像特征由網(wǎng)絡(luò)自動(dòng)確定。深度學(xué)習(xí)方法的一個(gè)具體例子是卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN)。而人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(ANN)使用神經(jīng)元激活網(wǎng)絡(luò)作為其類(lèi)似的模型。CNN則是基于視覺(jué)系統(tǒng)中的視網(wǎng)膜場(chǎng)。無(wú)論哪種方法,深度學(xué)習(xí)需要更長(zhǎng)的時(shí)間來(lái)然而,深度學(xué)習(xí)需要更長(zhǎng)的時(shí)間來(lái)訓(xùn)練,其架構(gòu)也更加復(fù)雜。然而,隨著復(fù)雜性的增加,非常令人印象深刻的分類(lèi)和識(shí)別率是可以實(shí)現(xiàn)的。
深度學(xué)習(xí)已經(jīng)被應(yīng)用于植物病害檢測(cè)問(wèn)題。Mohanty使用CNN檢測(cè)了14種作物的26種疾病。使用了由54,306張彩色圖像組成的數(shù)據(jù)集,80%用于訓(xùn)練,20%用于測(cè)試AlexNet和GoogLeNet(兩種流行的預(yù)訓(xùn)練CNN版本)。AlexNet的準(zhǔn)確率為97.82%,GoogLeNet的準(zhǔn)確率為98.36%,使用彩色圖像從頭開(kāi)始訓(xùn)練(轉(zhuǎn)移學(xué)習(xí)的數(shù)值更高,分別為99.27和99.34%)。他們選擇了具有同質(zhì)背景的單個(gè)葉片。如果在與訓(xùn)練圖像不同的條件下對(duì)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行測(cè)試,準(zhǔn)確率為31.4%。Sladojevic也使用CNN檢測(cè)各種作物植物的13種疾病,包括蘋(píng)果(白粉病、銹?。?、梨(葉斑病)、葡萄(枯萎病、螨蟲(chóng)、白粉病、霜霉?。?,使用CaffeNet,準(zhǔn)確率為96.3%。
目前很少有完整的研究將深度學(xué)習(xí)應(yīng)用于高光譜數(shù)據(jù),盡管這是一個(gè)活躍的研究領(lǐng)域。為了將高光譜數(shù)據(jù)用于深度學(xué)習(xí),有幾個(gè)挑戰(zhàn)需要解決。高光譜數(shù)據(jù)的大小,包括波長(zhǎng)的數(shù)量,需要大量的處理時(shí)間和功率,最好是需要一個(gè)圖形處理單元。超光譜波長(zhǎng)的數(shù)量很可能包括來(lái)自特定波長(zhǎng)的噪聲。另外,在訓(xùn)練/測(cè)試過(guò)程中,需要有足夠的數(shù)據(jù)量和標(biāo)記的數(shù)據(jù)。還有一種可能性是,誤差會(huì)比其他方法高。
其他非深度學(xué)習(xí)方法包括Yuan,使用FishersLinearDiscriminantAnalysis與遙感數(shù)據(jù)檢測(cè)小麥作物的黃銹病和白粉病,總體準(zhǔn)確率為93%,選擇的波長(zhǎng)范圍(531,570-654,685-717nm)對(duì)檢測(cè)白粉病和黃銹病在這些規(guī)格反射范圍內(nèi)的差異有意義,結(jié)果是獨(dú)立t檢驗(yàn)。
有時(shí),數(shù)據(jù)分析方法與簡(jiǎn)單的圖像處理步驟相結(jié)合,以增加特征識(shí)別。一系列被稱(chēng)為形態(tài)學(xué)運(yùn)算符的圖像處理技術(shù)可以用來(lái)清理二元(黑白)圖像。其中一種技術(shù)叫做侵蝕,通過(guò)將邊界像素變成背景像素來(lái)縮減物體的前景。相反的技術(shù)被稱(chēng)為"擴(kuò)張",其效果是擴(kuò)大前景物體的邊界。它們可以一起用于填補(bǔ)孔洞,或去除二進(jìn)制標(biāo)記數(shù)據(jù)中的斑點(diǎn)噪聲(取決于使用的順序)。使用這種方法的一種方法是對(duì)黃瓜葉子數(shù)據(jù)的研究,在這個(gè)例子中,這種技術(shù)被用來(lái)分析不同類(lèi)型的霉菌;霜霉病(Pseudoperonosporacubensis)。首先應(yīng)用原則成分分析(PCA)來(lái)減少數(shù)據(jù)的大小,并產(chǎn)生一個(gè)二進(jìn)制圖像,然后在第二步中使用侵蝕和擴(kuò)張來(lái)增強(qiáng)疾病特征。準(zhǔn)確率為90%,但是只使用了20個(gè)樣本(10個(gè)健康的和10個(gè)感染的)。這種方法不太可能在其他高光譜圖像上有很好的效果來(lái)檢測(cè)疾病,除非葉片數(shù)據(jù)相似,即使如此,結(jié)果也是不確定的。
高光譜成像也可以與顯微鏡相結(jié)合,以更高的分辨率捕捉圖像。對(duì)具有不同基因型的大麥進(jìn)行了微觀層面的研究,以了解是否可以確定基因型之間的光譜差異。還分析了健康和患病植物的大麥葉片,這些植物被接種了白粉?。˙.graminis)。結(jié)果表明,除了那些含有霜霉病基因座o(mlo)的品種外,健康和接種的葉片之間存在著時(shí)間上的差異,該基因座提供了植物對(duì)B.graminis的抗性。在這項(xiàng)研究中,由于噪聲的影響,光譜范圍被縮小到420-830納米,然后用Savitzky-Golay濾波器進(jìn)行歸一化和平滑處理,然后用SiVM來(lái)尋找極端光譜,接著用Dirichlet聚集回歸來(lái)尋找葉痕。
3.3使用全光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行分類(lèi)
分類(lèi)方法的目的是將數(shù)據(jù)分為若干不同的類(lèi)別。它們?cè)从谝幌盗械慕y(tǒng)計(jì)或機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)。其中一種方法是二次判別分析(QDA),它通過(guò)使用協(xié)方差矩陣來(lái)進(jìn)行分類(lèi),該矩陣將各個(gè)類(lèi)別進(jìn)行比較。QDA方法被用于牛油果植物的研究,以檢查真菌疾病月桂樹(shù)枯萎?。≧affaelealauricola),使用位于田間和玻璃溫室的植物。QDA的分類(lèi)準(zhǔn)確率為94%。當(dāng)然,在分析管道的每個(gè)階段都有可能使用替代方法。例如,不使用QDA,而是使用決策樹(shù)方法(一種機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)),其準(zhǔn)確率達(dá)到95%。為數(shù)據(jù)選擇正確的方法,以及確保足夠的數(shù)據(jù)集大小和質(zhì)量,是關(guān)鍵。這種機(jī)器學(xué)習(xí)方法代表了一套越來(lái)越常見(jiàn)的分類(lèi)和預(yù)測(cè)算法。機(jī)器學(xué)習(xí)方法使用訓(xùn)練數(shù)據(jù)集來(lái)訓(xùn)練算法,目的是分析和預(yù)測(cè)新的、未見(jiàn)過(guò)的數(shù)據(jù)的結(jié)果。多層網(wǎng)絡(luò)(MultilayerLowe)是這種技術(shù)的一個(gè)例子。MLP是簡(jiǎn)單的網(wǎng)絡(luò)(稱(chēng)為人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)),將輸入數(shù)據(jù)映射到輸出。這個(gè)過(guò)程是基于對(duì)神經(jīng)元激活網(wǎng)絡(luò)的生物學(xué)理解,其中信息在神經(jīng)元之間被發(fā)射。輸入節(jié)點(diǎn)連接到輸出,使用激活函數(shù)和權(quán)重進(jìn)行更新,可以?xún)?yōu)化產(chǎn)生正確的輸出(使用訓(xùn)練數(shù)據(jù))。這種算法需要先驗(yàn)知識(shí)(訓(xùn)練數(shù)據(jù)),因此,如果"疾病光譜"是未知的,那么這種技術(shù)將是不適合的。
第三種分類(lèi)方法是通過(guò)使用導(dǎo)數(shù)來(lái)觀察規(guī)格特征;這時(shí)要分析數(shù)據(jù)的基本模式或變化。二階(及以上)導(dǎo)數(shù)通常對(duì)光照的變化不敏感;但是它們對(duì)高光譜數(shù)據(jù)通常遭受的噪聲敏感,因此在使用導(dǎo)數(shù)之前需要應(yīng)用"平滑"。平滑化是一個(gè)過(guò)程,利用平均化的形式減少單個(gè)像素強(qiáng)度和相鄰像素之間的差異,以創(chuàng)造一個(gè)更平滑的信號(hào)。兩個(gè)平滑的例子是Savitsky-Golay和高斯過(guò)濾。Savitszky-Golay提出了一種通過(guò)對(duì)輸入數(shù)據(jù)的子集擬合局部多項(xiàng)式來(lái)平滑噪聲數(shù)據(jù)的方法,然后在單點(diǎn)評(píng)估多項(xiàng)式來(lái)平滑信號(hào)。高斯濾波通過(guò)使用高斯加權(quán)核對(duì)中心信息進(jìn)行平均化,從而減少噪聲。
Huang試圖通過(guò)使用帶有一階和二階導(dǎo)數(shù)的偏最小二乘回歸(PLSR)來(lái)檢測(cè)芹菜作物的硬霉菌腐爛病。部分最小二乘法回歸選擇一組小的成分。這種技術(shù)在預(yù)測(cè)因子是串聯(lián)的/高度相關(guān)的情況下是有用的,它將減少對(duì)數(shù)據(jù)的過(guò)度擬合的風(fēng)險(xiǎn)。使用原始光譜的偏最小二乘回歸的分類(lèi)精度為88.92%,使用Savitzky-Golay一階導(dǎo)數(shù)的PLSR為88.18%,使用二階導(dǎo)數(shù)的PLRS為86.38%。準(zhǔn)確率相似,二階導(dǎo)數(shù)的表現(xiàn)稍差。Yuan在Fisher的線(xiàn)性判別分析(FLDA)上使用PLSR來(lái)檢測(cè)小麥的病蟲(chóng)害。它對(duì)蚜蟲(chóng)危害的準(zhǔn)確率為60%,對(duì)黃銹病的準(zhǔn)確率為92%。在另一項(xiàng)研究中,Zhang使用FLDA檢測(cè)小麥的白粉病(使用嚴(yán)重受損的葉片),準(zhǔn)確率超過(guò)90%。
3.4疾病識(shí)別
除了檢測(cè)疾病的存在,研究的另一個(gè)方向是區(qū)分不同的疾病,以確定特定的病原體。其中一種方法是光譜信息分歧分類(lèi)。該方法比較了觀察到的光譜和參考光譜(光譜庫(kù),或數(shù)據(jù)中感興趣的平均光譜)之間的分歧,分歧值越小,光譜就越相似,如果它們大于設(shè)定的閾值,則不被歸類(lèi)為參考光譜。光譜信息分歧被用來(lái)檢測(cè)柑橘類(lèi)水果(葡萄柚)上的柑橘軍團(tuán),數(shù)據(jù)的光譜范圍是450-930納米,有92個(gè)波段,其中有1個(gè)波段的數(shù)據(jù)。5.2納米的光譜分辨率。在分析數(shù)據(jù)之前,通過(guò)合并相鄰的像素來(lái)減少一半的尺寸,進(jìn)行了預(yù)處理步驟。腐爛的葡萄果實(shí)與正常的葡萄果實(shí)以及出現(xiàn)其他疾病或損害癥狀的葡萄果實(shí)進(jìn)行了比較,包括:油漬、昆蟲(chóng)損害、黑色素、結(jié)痂和風(fēng)疤;這種方法的分類(lèi)準(zhǔn)確率為95.2%。
4. 量化疾病的嚴(yán)重程度
在檢測(cè)和分類(lèi)疾病的同時(shí),我們可能希望記錄疾病的有效數(shù)量,或其嚴(yán)重程度。這種方法確實(shí)遇到了一些特殊的挑戰(zhàn)。病害對(duì)葉片的損害和覆蓋程度會(huì)影響葉片被歸類(lèi)為健康或病害的準(zhǔn)確性。極端的病害會(huì)影響葉片的外觀,以至于它們可能根本就不能被算作植物材料。盡管如此,仍有許多方法可以估計(jì)嚴(yán)重程度,下面我們介紹一些方法。
光譜角度映射器(SAM)方法將像素光譜與參考光譜相匹配,通過(guò)計(jì)算光譜之間的角度對(duì)像素進(jìn)行分類(lèi),這些光譜被視為空間中的n維向量。這種技術(shù)已被廣泛用于高光譜數(shù)據(jù)的分類(lèi),包括植物病害,并取得了一定的成功。Yuhas研究了收獲前小麥鐮刀菌頭孢病的嚴(yán)重程度。高光譜數(shù)據(jù)的波長(zhǎng)范圍為400-1000納米,光譜分辨率為2.5納米。SAM用于檢測(cè)病害的數(shù)量,分類(lèi)準(zhǔn)確率為87%。對(duì)小麥植物進(jìn)行了兩個(gè)實(shí)驗(yàn),一個(gè)在玻璃溫室,一個(gè)在田間。對(duì)植物從接種到建立感染的整個(gè)發(fā)展階段進(jìn)行了成像。Yuhas確定,在感染后,健康和受感染的植物是無(wú)法區(qū)分的,因?yàn)楦腥具€沒(méi)有建立。然而,當(dāng)高光譜數(shù)據(jù)在成熟階段被檢查時(shí),小麥的色素組成發(fā)生了變化,健康的植株就會(huì)顯示為患病的植株。
Mahlein使用同樣的技術(shù)來(lái)分析甜菜病害,特別是Cerospora葉斑病、白粉病和葉銹病。范圍是400-1000納米,2.8納米的光譜分辨率和0.19毫米的空間分辨率。在一段時(shí)期內(nèi)(>20天)對(duì)植物進(jìn)行分析,以監(jiān)測(cè)每種病害的不同階段,并將葉片分類(lèi)為健康或病害。Cerospora葉斑病的分類(lèi)精度取決于疾病的嚴(yán)重程度(89.01-98.90%),白粉病的精度在90.18-97.23%之間,甜菜銹病達(dá)到61.70%,在第20天之前沒(méi)有使用SAM進(jìn)行分類(lèi)。
Rumpf等人使用了與Mahlein相同的數(shù)據(jù)集,但采用了不同的分析方法;決策樹(shù)(DT)、人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(ANN)和支持向量機(jī)(SVM)。所有的方法都需要先驗(yàn)知識(shí),但是一旦經(jīng)過(guò)訓(xùn)練就被證明是有效的。例如,對(duì)于Cerospora葉斑病,SVM的準(zhǔn)確率為97%(DT為95%,ANN為96%);對(duì)于甜菜銹病,準(zhǔn)確率為93%(DT為92%,ANN為95%);而對(duì)于白粉病,準(zhǔn)確率為93%(DT為86%,ANN為91%)。在病害覆蓋了1-2%的葉片后,用葉片面積覆蓋率測(cè)量嚴(yán)重程度,準(zhǔn)確率為62-68%,對(duì)于超過(guò)10%的葉片覆蓋率,準(zhǔn)確率幾乎為100%。這表明,在同一組高光譜數(shù)據(jù)上使用各種分析方法來(lái)闡明不同的見(jiàn)解并達(dá)到不同的準(zhǔn)確度--選擇技術(shù)很重要。表2列出了用于識(shí)別特定疾病的常用技術(shù)以及與之相關(guān)的準(zhǔn)確性。
5.檢測(cè)早期的壓力癥狀
這種檢測(cè)系統(tǒng)的最終目標(biāo)是在對(duì)植物進(jìn)行最少的物理改變的情況下識(shí)別疾病。盡可能早地識(shí)別疾病或非生物問(wèn)題有明顯的好處。通過(guò)使用高光譜技術(shù)與適當(dāng)?shù)姆治龇椒ㄏ嘟Y(jié)合,我們可以現(xiàn)實(shí)地希望在人工觀察之前識(shí)別壓力癥狀。
干旱對(duì)許多作物來(lái)說(shuō)是一個(gè)重大問(wèn)題,特別是一些植物種類(lèi)或品種在一段時(shí)間內(nèi)不會(huì)明顯顯示出這種壓力,到這時(shí),作物的潛在產(chǎn)量或質(zhì)量可能已經(jīng)下降,因?yàn)橹参锏恼0l(fā)育過(guò)程已經(jīng)通過(guò)壓力反應(yīng)受到影響。干旱的定義也可以從少量缺水到完全缺水不等。本節(jié)所討論的研究在植被指數(shù)檢測(cè)到干旱之前就已經(jīng)檢測(cè)到了干旱的發(fā)生,而且是在明顯跡象出現(xiàn)之前幾天。
特別是在干旱脅迫的早期檢測(cè)中,有一項(xiàng)技術(shù)已經(jīng)成為流行的技術(shù),那就是單純體積最大化(SiVM),它是一種數(shù)據(jù)聚類(lèi)技術(shù)。這種技術(shù)選擇健康和受壓植物的光譜特征,然后用這些類(lèi)別對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類(lèi)。當(dāng)簽名變得與預(yù)先學(xué)習(xí)的樣本簽名相似時(shí),它就被歸類(lèi)為此類(lèi)。
Romer研究了包含在防雨棚中的大麥試驗(yàn)和在田間種植的玉米試驗(yàn)中的干旱壓力。用來(lái)檢測(cè)壓力的技術(shù)是單純的體積最大化,這是一種無(wú)監(jiān)督的技術(shù)。光譜范圍為400-900納米,光譜分辨率為4納米。在預(yù)處理過(guò)程中,一些波長(zhǎng)由于噪聲而被去除(<470和>750納米)。這是高光譜數(shù)據(jù)常見(jiàn)的情況,因?yàn)楣庾V范圍末端的光線(xiàn)不足,特別是基于實(shí)驗(yàn)室的光源,可能在光譜的這些區(qū)域沒(méi)有產(chǎn)生很多光線(xiàn)。為了減少數(shù)據(jù)的大小并去除背景,采用了K-means聚類(lèi)方法,用平均顏色將數(shù)據(jù)分成選定的若干組。然后將SiVM與四種眾所周知的植被指數(shù)--NDVI、光化學(xué)反射指數(shù)(PRI)、紅邊滲透點(diǎn)(REIP)和類(lèi)胡蘿卜素反射指數(shù)(CRI)進(jìn)行比較。對(duì)于大麥的數(shù)據(jù),使用SiVM(第9天)比Vegeta-tionIndices(第13天)更早發(fā)現(xiàn)部分水脅迫的減少。對(duì)于無(wú)水/完全干旱條件下的植物,植被指數(shù)在第8天檢測(cè)到脅迫,比SiVM快一天,但它們未能在第9天和第10天檢測(cè)到脅迫;然而SiVM確實(shí)從第9天開(kāi)始可靠地檢測(cè)到脅迫植物。
Behmann還使用支持向量機(jī)(SVM)分析了大麥的干旱壓力。這種算法是超視距的,需要標(biāo)記的訓(xùn)練數(shù)據(jù),在這種情況下,它被標(biāo)記為干旱或健康。在用SVM分析之前,數(shù)據(jù)經(jīng)過(guò)K-means預(yù)處理,以減少數(shù)據(jù)集的大小。光譜范圍為430-890納米,光譜分辨率為4納米。使用這種方法,Behmann在第6天檢測(cè)到干旱壓力,在第16天檢測(cè)到NDVI差異。
小麥的干旱脅迫已經(jīng)通過(guò)兩種組合技術(shù)進(jìn)行了分析,試圖提高檢測(cè)率。Moshou使用最小二乘支持向量機(jī)(LSSVM)來(lái)嘗試檢測(cè)干旱脅迫。在溫室中研究了小麥植物,并對(duì)光譜反射和熒光進(jìn)行了分析。熒光包括使用高強(qiáng)度的光來(lái)激發(fā)植物組織,使其發(fā)出不同波長(zhǎng)的光,這可以用來(lái)獲得額外的生物洞察力。LSSVM需要進(jìn)行訓(xùn)練,846個(gè)數(shù)據(jù)樣本被用于訓(xùn)練,而302個(gè)數(shù)據(jù)樣本被用于測(cè)試階段。對(duì)于一些技術(shù)來(lái)說(shuō),由于計(jì)算時(shí)間的原因,數(shù)據(jù)集的大小和/或波長(zhǎng)的數(shù)量將決定分析數(shù)據(jù)的時(shí)間。因此,Moshou使用了六個(gè)波長(zhǎng)-503、545、566、608、860和881納米。LSSVM對(duì)脅迫葉片的準(zhǔn)確率達(dá)到76.3%,對(duì)健康葉片的準(zhǔn)確率達(dá)到86.6%。然而,該研究指出,通過(guò)使用融合光譜和熒光特征的LSSVM模型,總體準(zhǔn)確率大于99%。熒光是對(duì)葉子中葉綠素?zé)晒獾臏y(cè)量,以確定生理變化。
根據(jù)Kersting,許多這些技術(shù)很難用于非機(jī)器學(xué)習(xí)或數(shù)據(jù)挖掘?qū)<?,因?yàn)楦吖庾V數(shù)據(jù)需要預(yù)先處理或適應(yīng)(即尋找葉片或使用選定的波長(zhǎng))。此外,除了之外,其他技術(shù)都沒(méi)有對(duì)大量植物進(jìn)行幾天的分析。當(dāng)有大量的數(shù)據(jù)需要分析時(shí),這是植物表型分析需要考慮的一個(gè)重要因素。Ker-Sting聲稱(chēng)擁有第一個(gè)使用高光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行干旱壓力預(yù)測(cè)的人工智能技術(shù)。開(kāi)發(fā)了一種新的方法,其中包括一種不調(diào)整數(shù)據(jù)或縮小尺寸的干旱預(yù)測(cè)技術(shù)。Kersting在一個(gè)大麥干旱實(shí)驗(yàn)中展示了該方法,其數(shù)據(jù)是在五周內(nèi)收集的。使用的技術(shù)被稱(chēng)為Dirichlet聚集回歸(DAR),它是基于矩陣因子化的。首先,SimplexVol-umeMaximisation被用來(lái)從數(shù)據(jù)中找到50個(gè)光譜特征并對(duì)它們進(jìn)行分類(lèi)。然后,在對(duì)這些值使用高斯過(guò)程之前,對(duì)潛在的迪里切特聚集值進(jìn)行估計(jì),以找到每個(gè)植物和每個(gè)時(shí)間點(diǎn)的干旱程度。最后,在出現(xiàn)明顯跡象之前,該過(guò)程預(yù)先預(yù)測(cè)受干旱影響的植物。根據(jù)一個(gè)為期五周的大麥實(shí)驗(yàn),干旱的預(yù)測(cè)發(fā)生在可見(jiàn)跡象出現(xiàn)之前的1.5周。對(duì)SiVM和DAR的運(yùn)行時(shí)間進(jìn)行了評(píng)估,結(jié)果是并行的SiVM的運(yùn)行時(shí)間為30分鐘,而使用DAR模型只需幾分鐘。這表明,開(kāi)發(fā)定制的分析技術(shù)可以超越現(xiàn)有方法的直接應(yīng)用(無(wú)論是在計(jì)算時(shí)間、所需假設(shè)、易用性還是最終的準(zhǔn)確性方面)。
6.高光譜數(shù)據(jù)采集和軟件
高光譜數(shù)據(jù)的尺寸很大,尤其是對(duì)多種植物進(jìn)行連續(xù)幾天的成像時(shí)。對(duì)一種植物的掃描可以很容易地達(dá)到大約一千兆字節(jié)的大小。如果對(duì)整個(gè)光譜范圍進(jìn)行分析,那么這個(gè)過(guò)程將比選擇幾個(gè)波段進(jìn)行分析要長(zhǎng)得多。然而,有大量的信息數(shù)據(jù)中包含的信息可能是有價(jià)值的。研究人員必須決定使用多少光譜分辨率,以及放棄多少。如果你的相機(jī)收集了800個(gè)光譜帶,你必須問(wèn)自己是否需要所有的800個(gè)光譜帶,還是分成400個(gè)或200個(gè)等光譜帶就足夠了。這類(lèi)似于對(duì)RGB圖像使用類(lèi)似JPEG的壓縮方式。這種壓縮創(chuàng)造了更小的文件尺寸,但代價(jià)破壞了圖像信息(特別是色彩信息)。儲(chǔ)存較少的光譜帶會(huì)產(chǎn)生較小的文件大小,并降低數(shù)據(jù)分析的復(fù)雜性,但代價(jià)是丟掉潛在的重要顏色屬性。Polder等人探討了使用三個(gè)系統(tǒng)設(shè)置的攝譜儀的校準(zhǔn)和特性。實(shí)驗(yàn)研究了不同類(lèi)型的噪聲和信噪比。實(shí)驗(yàn)還確定,通過(guò)計(jì)算分辨率、光譜范圍和像素?cái)?shù)量,在一定程度上可以進(jìn)行分選而不損失信息。
6.1高光譜相機(jī)的設(shè)置
在分析之前,需要對(duì)高光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行校準(zhǔn),以確保產(chǎn)生的圖像由于存在的照明顏色而得到調(diào)整;相機(jī)軟件可能有此選項(xiàng),但如果沒(méi)有,則可在捕獲數(shù)據(jù)后進(jìn)行校準(zhǔn)。照明是通過(guò)一個(gè)已知的白平衡目標(biāo)進(jìn)行校準(zhǔn)的,它由相機(jī)系統(tǒng)成像。這個(gè)目標(biāo)將在光譜上反映一個(gè)已知的百分比的光,例如,在相機(jī)的整個(gè)工作光譜上反映99%。照明的非均勻性可以通過(guò)將觀察到的數(shù)據(jù)除以捕獲的白平衡數(shù)據(jù)來(lái)校正[49]。此外,系統(tǒng)必須對(duì)傳感器在無(wú)光情況下出現(xiàn)的電噪聲(稱(chēng)為暗電流)進(jìn)行校正。這通常是通過(guò)在沒(méi)有任何光線(xiàn)的情況下用相機(jī)拍攝圖像來(lái)進(jìn)行的,并使用由此產(chǎn)生的低水平噪聲讀數(shù)來(lái)調(diào)整未來(lái)的措施。
一個(gè)重要的問(wèn)題是多長(zhǎng)時(shí)間進(jìn)行一次白平衡校準(zhǔn)。在實(shí)驗(yàn)室環(huán)境中,每個(gè)月只拍攝一個(gè)白平衡目標(biāo)可能是合適的。實(shí)驗(yàn)中,假設(shè)照明已經(jīng)達(dá)到一個(gè)平衡點(diǎn)(即燈泡已經(jīng)完全預(yù)熱)。然而,在實(shí)驗(yàn)室外,照明受到的變化要大得多。云層、陰影和一天中的時(shí)間都會(huì)非常影響外面的光線(xiàn)顏色,因此必須定期進(jìn)行白平衡讀數(shù),以確保準(zhǔn)確的校準(zhǔn)。還必須仔細(xì)選擇一天中拍攝圖像的時(shí)間,以及是否在陰天和陽(yáng)光直射的情況下進(jìn)行拍攝(這可能導(dǎo)致陰影和鏡面反射的問(wèn)題--植物上的亮斑直接反射照明源(即太陽(yáng)))。還應(yīng)考慮照明的均勻性--傳感器是否在其空間范圍內(nèi)記錄了均勻的亮度水平?一種被稱(chēng)為漸暈的效果會(huì)導(dǎo)致鏡頭邊緣的像素看起來(lái)比中心的像素更暗。
7.結(jié)論
近年來(lái),專(zhuān)注于利用高光譜圖像分析檢測(cè)植物壓力的科學(xué)文獻(xiàn)顯著增加。植物病害檢測(cè)是農(nóng)業(yè)和園藝作物管理中的一項(xiàng)重要活動(dòng)。特別是,檢測(cè)早期的壓力和疾病將對(duì)農(nóng)民和種植者有利,因?yàn)樗鼘⑹乖缙诟深A(yù)有助于減輕作物損失和降低作物質(zhì)量。高光譜成像是一個(gè)非侵入性的過(guò)程,通過(guò)掃描植物來(lái)收集高分辨的數(shù)據(jù)。該技術(shù)正變得越來(lái)越流行,因?yàn)橄鄼C(jī)生產(chǎn)成本的下降使研究人員和開(kāi)發(fā)人員能夠更多地使用這種技術(shù)。有各種技術(shù)可用于分析數(shù)據(jù),以檢測(cè)植物的生物和非生物脅迫,本評(píng)論中討論了其中的例子,重點(diǎn)是健康和患病植物的分類(lèi)、疾病的嚴(yán)重程度和脅迫癥狀的早期檢測(cè)。
植被和疾病指數(shù)的數(shù)量每年都在增加。顯著的波長(zhǎng)組合在一起可以表明特定物種的健康或疾病狀況。然而,指數(shù)對(duì)于檢測(cè)植被的具體標(biāo)準(zhǔn)是很有價(jià)值的;指數(shù)是根據(jù)當(dāng)時(shí)的數(shù)據(jù)集、物種和對(duì)實(shí)驗(yàn)有利的條件選擇的。有些指數(shù)更具有普遍性;NDVI、PRI和其他幾個(gè)植被指數(shù)將致力于發(fā)現(xiàn)植物的一般健康狀況。但一般來(lái)說(shuō),要把為植物X設(shè)計(jì)的指數(shù)應(yīng)用于植物Y的數(shù)據(jù)集是比較困難的。這就是考慮在光譜上采用更大范圍的波長(zhǎng)的動(dòng)機(jī),這有可能產(chǎn)生更好的結(jié)果。
摘自:Hyperspectralimageanalysistechniquesforthedetectionandclassificationoftheearlyonsetofplantdiseaseandstress:AmyLowe,NicolaHarrisonandAndrewPFrench